在Windows操作系统中，关闭应用进程的自启动有几种常用的方法，下面我将为你详细介绍：
1. 设置（注：此方法虽简单，但只能关闭部分应用）
在设置窗口中，点击“应用”选项。
在“应用”页面中，点击“启动”选项。
在“启动”页面中，会列出所有可以自启动的应用程序。
找到你想要关闭自启动的应用，点击它旁边的开关，将其关闭即可。
2. 任务管理器（注：此方法和使用设置所能关闭应用范围一样）
打开任务管理器：可以通过按 Ctrl + Shift + Esc 快捷键，或者右键点击任务栏选择“任务管理器”来打开。
找到启动选项卡：在任务管理器的界面中，点击顶部的“启动”选项卡，这里会列出所有在系统启动时会自动运行的程序。
禁用自启动程序：在启动选项卡中，找到你想要关闭自启动的应用程序，点击该应用程序，然后点击右下角的“禁用”按钮即可。禁用后，该应用程序在系统启动时就不会自动运行了。
3. msconfig系统配置工具（注：此方法可以覆盖绝大多数应用进程）
打开系统配置工具：按下 Win + R 打开“运行”对话框，输入 msconfig 并回车，打开系统配置工具。
切换到启动选项卡：在系统配置工具的界面中，点击顶部的“启动”选项卡。
禁用自启动程序：在启动选项卡中，会列出所有自启动程序，找到你想要关闭的应用程序，取消其前面的勾选框即可。然后点击“应用”和“确定”保存设置，并重启计算机使更改生效。
4. 系统服务管理（注：此方法可以覆盖绝大多数应用进程）
有些应用程序是通过系统服务的形式实现自启动的，可以通过服务管理来禁用。
打开服务管理：使用Windows搜索框搜索“服务”并点击打开或者按下 Win + R 打开“运行”对话框，输入 services.msc 并回车，打开服务管理。
找到并禁用服务：在服务管理的列表中，找到对应的应用程序服务，右键点击选择“属性”，在“启动类型”下拉菜单中选择“禁用”，然后点击“应用”和“确定”保存设置。
5. 注册表编辑器
打开注册表编辑器：使用Windows搜索框搜索注册表并点击打开或者按下 Win + R 打开“运行”对话框，输入 regedit 并回车，打开注册表编辑器。
定位启动项：在注册表编辑器中，依次展开 HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run 和 HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run 这两个路径，这两个路径下存放了大部分自启动程序的注册表项。
修改或删除启动项：在上述路径下找到对应的应用程序启动项，右键点击该项，选择“删除”即可移除自启动。如果只是想暂时禁用而不是完全删除，可以双击该项，将其“数值数据”修改为空字符串。
注意：修改注册表前建议先备份注册表，以防误操作导致系统问题。
6. 第三方软件
市面上有许多第三方的系统管理软件，如Autoruns、CCleaner等，它们提供了更直观、更方便的管理自启动程序的功能。
使用Autoruns：打开Autoruns软件，它会列出系统中所有可能的自启动位置，包括注册表、启动文件夹等。找到对应的应用程序，右键点击选择“禁用”或“删除”即可。Autoruns具体安装使用教程可参考该博客：AutoRuns下载安装使用教程（图文教程）超详细-CSDN博客
以上就是在Windows系统中关闭应用进程自启动的几种方法，大家可以根据自己的需求和习惯选择合适的方法进行操作。